В 1945 р. його перейменовано в Одеський інститут інженерів морського флоту (ОІІМФ). Постановою Кабінету Міністрів України № 592 від 29 серпня 1994 р. інститут перейменовано в Одеський державний морський університет (ОДМУ). Указом президента України від 26 лютого 2002 р. №177/2002 університету надано статус національного (ОНМУ).
ОНМУ знаходиться у безпосередньому підпорядкуванні Міністерства освіти і науки України. За результатами державної акредитації університет акредитовано за IV рівнем. (ліцензія серія АА № 903575 від 07 липня 2004 р., сертифікат про акредитацію серія РД- 4 № 160365 від 07 липня 2004 р.). У 2003 році ОНМУ успішно пройшов сертифікацію на відповідність міжнародному стандарту ІSO 9001:2000 Системи Менеджменту Якості.
До складу університету входить 10 факультетів: кораблебудівний, судномеханічний, механізації портів, воднотранспортних і шельфових споруд, транспортних технологій і систем, економіки і управління, юридичний, післядипломної освіти та підвищення кваліфікації, заочний, довузівської підготовки молоді. На факультетах університету готують фахівців для берегової інфраструктури морського і річкового транспорту України та закордонних країн за 12 спеціальностями: кораблі та океанотехніка, інформаційні управляючі системи та технології, суднові енергетичні установки та устаткування, експлуатація суднових енергетичних установок, підйомно-транспортні, будівельні, дорожні, меліоративні машини і обладнання, гідротехнічне будівництво, транспортні системи, організація перевезень і управління на транспорті, управління проектами, економіка підприємства, менеджмент організацій, правознавство.
В університеті здійснюється післядипломна підготовка фахівців вищого рівня через аспірантуру та докторантуру за такими спеціальностями: аспірантура - машинознавство; підйомно-транспортні машини; теорія корабля; механіка та конструювання суден; технологія суднобудування та судноремонту; суднові енергетичні установки; автоматизовані системи управління та прогресивні інформаційні технології; управління проектами та розвиток виробництва; технічна теплофізика, промислова теплоенергетика; транспортні системи; підвалини та фундаменти; гідравліка та інженерна гідробіологія; статистика; економіко-математичне моделювання; економіка підприємництва та організація виробництва; бухгалтерський облік, аналіз та аудит; економіка транспорту і зв’язку; соціальна філософія та філософія історії; кримінальне право та кримінологія, кримінально-виконавче право.