Інститут нейрохiрургiї iм. акад. А. П. Ромоданова АМН України заснований у 1950 роцi на базi i як спадкоємець Київського психоневрологiчного iнституту.
Органiзатором iнституту та його першим директором став учень та послiдовник акад. М. Н. Бурденка академiк О. І. Арутюнов, який очолював Інститут з 1950 по 1964 р. За задумом О. І. Арутюнова, iнститут був створений як комплексна науково-дослiдна лiкувальна установа, в котрiй разом з нейрохiрургами працювали спецiалiсти сумiжних професiй. Цей принцип комплексностi вирiшив надалi весь хiд формування вiтчизняної нейрохiрургiї i сприяв розвитку таких нових дисциплiн, як нейрорентгенологiя, отоневрологiя та нейроофтальмологiя, нейрофiзiологiя, нейропсихопатологiя та iнших.
Впродовж 30 рокiв (з 1964 по 1993) директором iнституту був академiк А. П. Ромоданов. Пiсля смертi А. П. Ромоданова iнституту присвоєно його iм'я.
З 1993 року iнститут очолює академiк АМН України Ю. П. Зозуля.
В Інститутi в рiзнi роки працювали видатнi нейрохiрурги: академiк О. І. Арутюнов, академiк А. П. Ромоданов, П. Г. Тананайко, д. м. н. П. О. Пронзелєв, О. І. Крiстер, Я. І. Файнзiльберг, проф. І. Д. Вiрозуб, проф. Б. А. Пельц, проф. В. Г. Станiславський, проф. Л. Є. Пелех, М. С. Рябоконь, Р. Л. Андрейко; невропатологи: проф. А. Д. Дiнабург, проф. О. Л. Духiн, І. С. Глушкова, М. К. Хорець-Бротман; психiатри: проф. А. Л. Абашев-Константинiвський, Г. Г. Дзевалтовська; нейропатоморфологи: проф. Б. С. Хомiнський, проф. Ю. М. Квiтницький-Рижов; нейрорентгенологи: Я. І. Гейнiсман, Л. П. Панкєєва, Т. Д. Подольський, Г. С. Даниленко й iншi вченi та спецiалiсти, що склали сузiр'я української нейрохiрургiчної науки.
В першi роки iснування iнституту основна увага колективу була спрямована на вирiшення проблеми вiддалених пiслявоєнних ускладнень травм черепа, головного та спинного мозку, периферичної, зокрема, вегетативної нервової системи. Потiм усе ширше почали розроблятись рiзнi аспекти внутрiшньочерепної гiпертензiї, набряку мозку, нейроонкологiї, судинних та запальних захворювань головного мозку, вад розвитку ЦНС, травми нервової системи мирного часу.
У подальший перiод розвитку Інституту змiнились напрямки його наукової дiяльностi та розширився дiапазон наукових проблем.